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醫院是一個龐大的組織系統，科室是構成這一系統的基本單元，是發揮醫院整體功能的基本結構。科室工作能否取得成效與醫院發展目標的實現密切相關，這除了科室員工的共同努力外，科室管理者管理職能的某些方面發揮也至關重要。醫院越大，科室的細分越精，甚至一個大的專科可以劃分出數個小的專科來。
隨著人們對醫學科學領域的拓展和研究，科室建設成為了一門管理學科。科室建設水平直接體現了醫院的社會影響力和核心競爭力。
科室管理又是醫院管理的核心和主體。醫院的整體績效主要由各個科室的績效體現出來，提高科室的經營管理水平、技術水平和服務能力是醫院管理的核心。在中國，大多數醫院的科室管理相對于發達國家的醫院管理較為落后。醫生的培養體制不同，醫院管理層的觀念也不同，導致醫院管理，尤其是科室管理在管理過程中出現了各種問題。
道恒就現代醫院科室管理存在的問題做簡單分析，供各位參考。
管理作為一門學科研究在我國起步較慢，人們對管理的實際運用并不熟練和深入。尤其是醫院的科室管理更是缺乏專業的指導，在管理知識以及管理實踐都較為薄弱。
科室管理者——科主任的個人素質、領導能力、事件處理能力較弱，管理覺悟不高。在我國，大多數科室管理者對于自身利益看的比較重，缺乏大局意識。
醫院科室在培育人才方面缺乏長遠的戰略規劃，大部分的醫院認為醫生的穩定性不高，對于人才方面的需求只追求短期的解決問題，而不結合醫院的發展戰略進行人才建設。而且，高端人才和學科到頭人都較鳳毛麟角，影響了整個科室的發展建設。
國內的醫療質量管理與發達國家相比差距較大，醫療操作缺乏規范說明和執行要求。比如在醫院中的查房比較形式化，醫生觀察病情比較走流程，探討病例不深入，搶救不規范等等醫療質量問題都存在。
以上三點是絕大部分醫院在科室管理中存在的典型問題，對于這些問題存在的原因歸根結底還是科室管理者對于科室管理知識、方法和技能的欠缺，只憑借經驗辦事，缺乏規范系統的管理崗位培訓。醫院方面對于醫院人才培養力度不大，人才梯隊建設不專業等。
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